Celý proces lyofilizácie vo vákuovom lyofilizačnom stroji je komplikovaný. Malá neopatrnosť môže viesť k zníženiu kvality lyofilizovaných produktov.
Preto je potrebné zvoliť softvér automatického riadiaceho systému podľa predpisov. Konštrukcia automatického riadiaceho a riadiaceho systému vákuovej vymrazovacej sušičky predpokladá, že skutočná prevádzka je jednoduchá.

Po vložení surovín sa tlačidlo spustí a mraziace vákuové čerpadlo sa oveľa ľahšie zdvihne a vysuší a po lyofilizácii sa vám pripomenie, aby ste počkali na kŕmenie. Niekedy lieky lyofilizované vo vákuovej lyofilizácii budú bublať.
Aké faktory potom spôsobia tento jav? Poďme analyzovať a predstaviť riešenie.
1.Frozen nie je pevný;
2. Vákuová pumpa nepracuje správne.
3. Nepochopenie charakteristík surovín.
4. Vyskytol sa problém s procesom zahrievania.
5. Kompaktnosť povrchovej štruktúry lyofilizovaného bloku, ktorá spôsobuje penenie pri odvode vnútornej pary, keď je suchý.
7. Ak činnosť vákuového čerpadla nie je veľmi dobrá, dôjde k situácii pri spustení a stroje a zariadenia by mali byť dobre udržiavané.
8. Ak je blistrový hneď po vákuovom balení, patrí to k tomu, že nie je zmrazený a surovina nie je úplne vykryštalizovaná.
9. Ak sa pena zahreje po určitom čase, patrí to k tomu, že ohrev je príliš rýchly, teplota materiálu presahuje teplotu eutektického bodu a surovina sa topí a pení.
10. Väzba suchosti (vzostupná väzba) prechádza do analýzy pred jej ukončením, takže surovina obsahujúca ľad, ktorá ešte neukončila kysnutie, sa roztopí a napení.
11. Ak je hodnota koncentrácie príliš vysoká a nie je rozlíšená, počas predmrazovania sa na povrchu suroviny vytvárajú vrstvy kryštalickej soli. Táto vrstva kryštalickej soli vážne poškodzuje bezpečný prechod vodnej pary, keď je surovina vyvýšená, čím sa stáva veľmi krátkym (asi 1 V priebehu hodiny sa objaví vydutie, o to vážnejšie to budú pľuzgiere.

